外界对李河君的争议一直存在。2012年6月21日，国家审计署发布的一则名为“5044个能源节约利用、可再生能源和资源综合利用项目审计结果”的公告，其中便指出广东汉能光伏10兆瓦光伏发电项目单位存在多报建设规模和装机容量的现象，违规获得中央财政金太阳示范工程补助资金2637.25万元。