话说第四次忍界大战结束后，各国之间直接或者间接死亡人数数以百万，这场忍界有史以来的大战带来了太多太多的伤痛。为了不让伤痛在今后蔓延。各国之间签订了和平条约组成了忍界联盟邦。从此之后忍界和平了将近50余年。直到有一天一个名为壳之国的小国壳影因不满5大国的和平条约，（所谓的各国和平条约里的各种条件只对大国有利。）而撕毁的条约。对邻国风之国不宣而战。很快风之国就沦陷了。第五代风影我爱罗也殉国了。
风之国被袭风影殉国的消息马上传到木叶忍者村，此时年近七十的旋涡鸣人闻讯悲痛欲绝。这时木叶的领导人己经是第八代火影木叶丸了。而鸣人的儿子是旋涡博人，博人与佐助的女儿佐良娜生下一子名唤“旋涡浪人”。
旋涡浪人，继承了爷爷旋涡鸣人的九尾之力（鸣人临终前把九尾过继到浪人身上，希望九尾能保护好自己的孙子浪人。）也继承了母亲佐良娜的写轮眼。最后升级成轮回眼。浪人这么厉害有没有比他更厉害的呢？答案是有的，雷门千金雷无艳，科学忍具第一人。创造了最强忍具“守护世界”类似于原子弹吧！那雷无艳又是谁呢？雷无艳是电气的女儿。后来拜大蛇丸为师，疯狂痴迷于科技创造和探索。那还有没有更厉害的，答案是肯定有，那就是“凉月”。凉月又是什么鬼，当然是己月的女儿了，那妈妈又是谁呢？是班长吧！叫“何凉月”。这货厉害了，如果说浪人是忍法忍术第一人，雷无艳是科技忍术第一人，那么何凉月就是仙术忍界第一人。己月不断研究仙术，最后的成果就在凉月身上了。仙术第一人可不是盖的实力不在浪人之下。
那么问题来了反派壳之国为了扩张搞了第5和第6次忍界大战，那么壳之国这种不起眼的弹丸小国又怎么会生出独吞忍界的野心呢？答案是幕后有人，有谁呢？那肯定是大筒木三人组了，大筒木三人组为了夺回查克拉果实，不惜带来了最先进的地外科技来到壳之国，使壳之国在短短的几年时间内发明各种先进的科技忍具，然后闪电般摧毁了风之国，还把各国打得落花流水，因此忍界揪起了一场科学忍具革命。最后木叶最强三人组打败了大筒木三人组，统一了忍界。最后就是忍界三神的帝位之争了。浪人退出忍界，无艳死于非命，最后的最后忍界千古女帝何凉月顺利坐拥天下。结束。。