20世纪50年代初，P.V.史密斯（Smith,1952,1954）等人成功地从现代海洋沉积物中分离鉴定出微量类似于原油的烃类化合物，从而使石油直接起源于类似现代沉积物有机质的观点得以广泛流传。50年代中期至60年代中期，随着气相色谱技术的广泛使用，人们可以从现代沉积物、土壤、沉积岩和石油天然气中抽提分离鉴定出大量的有机化合物，使研究工作大大深入。1959年11月美国匹兹堡成立了第一个国际性的有机地球化学协会，1962年首先于意大利米兰召开了第一届国际有机地球化学会议，出版了《有机地球化学进展》论文集，并定每两年召开一次学术会议。由于研究工作的深入，大量资料的积累，1963年I.A.布雷格（Breger,1963）主编了《有机地球化学》，分章论述了色素、氨基酸、碳水化合物、脂类、干酪根、煤、石油等地球化学。1964年俄罗斯学者亦出版了《有机质的地球化学》，重点论述了沉积金属矿产的有机地球化学。这标志着有机地球化学学科以完善独立的体系立于百科之林。
