AMH在男性和女性生长发育的不同阶段表达不同，基于其病理生理改变的最主要临床应用是评估女性的卵巢储备，并进一步为生殖系统相关疾病的辅助诊断及其他疾病治疗中的女性生育能力评估提供依据。AMH可调节男性睾丸间质细胞的功能；在成年女性中，AMH抑制原始卵泡的募集和窦卵泡的发育，防止卵泡过早耗竭。因此，AMH是卵巢储备功能指标中最为可靠稳定和方便的一个。

AMH的作用
1、评估卵巢储备功能：AMH在评估卵巢储备方面有很多明显的优点，是卵巢衰老最准确的生物标志物。AMH比FSH、雌二醇（E2）、抑制素B（inhB）和窦卵泡计数（AFC）更早反映卵巢储备随年龄下降的趋势]，且其水平不受月经周期、激素类避孕药和怀孕的影响。女性尤其是年轻女性月经周期内AMH存在一定波动，但其波动远小于其他性激素，故现有指南多支持在月经周期任意时间检测AMH。
2、辅助生殖：AMH水平可准确预测患者对控制下卵巢刺激的反应，并据此选择个性化治疗方案。AMH水平用于预测卵巢低反应的曲线下面积为0.81，显著高于年龄、基础FSH水平和AFC。卵巢过度刺激综合征（OHSS）是辅助生殖促排卵技术的主要并发症之一，而 AMH水平可较好预测OHSS。使用AMH水平预测促排卵患者发生卵巢低反应的切点值为1.1 ng/ml，预测卵巢过度刺激的切点值为2.6 ng/ml。
3、诊断多囊卵巢综合征：与健康排卵妇女相比，排卵多囊卵巢综合征（PCOS）患者卵泡液中AMH的浓度比正常值高出3~5倍。另一项研究显示，PCOS女性的血清AMH水平较正常排卵女性升高2～3倍，且血清 AMH水平越高，PCOS确诊率越高，当AMH水平>10 ng/ml时，PCOS的确诊率可达到97%～98.1%。
4、预测绝经期及诊断卵巢早衰：研究显示AMH是比母亲绝经年龄更好预测女性绝经年龄的指标；其另一项研究则显示，在包含了年龄、体重指数、年吸烟量和月经周期状态的多因素预测模型中加入AMH，可以显著提高这一模型预测10年内绝经概率的能力。卵巢早衰人群中仍有相当一部分血清FSH水平低于诊断切点值40 IU/ml，而血清AMH水平几乎100%低于绝经参考浓度，说明AMH能够比FSH更好地区分卵巢早衰。